Anni dopo l'inizio delle Guerre dei Cloni, i Sith portano a compimento un piano antichissimo, la Repubblica si sgretola e dalle sue ceneri sorge il malvagio Impero Galattico. Confermando le peggiori paure del Jedi Mace Windu (Samel L. Jackson), Anakin Skywalker (Hayden Christensen) viene sedotto dal Lato Oscuro della Forza e diventa il nuovo apprendista dell'Imperatore - Darth Vader. I Jedi vengono decimati e Obi-Wan Kenobi (Ewan McGregor) e il Maestro Yoda sono costretti a nascondersi. L'unica speranza per la Galassia sono gli stessi figli di Anakin... un ragazzo e una ragazza che condividono un eroico destino.