Un agente della Cia (Jean-Claude Van Damme) è imprigionato a bordo di un sottomarino nucleare, avamposto dell'intelligence americana, con l'accusa di tradimento. Per fortuna una task force con a capo un uomo tutto d'un pezzo (Dolph Lundgren), gli corre in soccorso affinché possa dimostrare la sua innocenza. Black Water segna la quinta collaborazione tra l'attore belga e l'attore svedese dopo la trilogia di Universal Soldier (1992, 2009, 2012) e l'operazione nostalgica de I Mercenari.