Alla fine della precedente stagione avevamo lasciato Gotham City nel caos più totale e ora la situazione non è di certo migliorata: la città è infestata dai mostri di Indian Hill, i quali sono sotto il comando di Fish Mooney (Jada Pinkett Smith), resuscitata. Gordon (Ben McKenzie) è alle prese con numerosi problemi personali e Oswald Cobblepot (Robin Lord Taylor), di nuovo a capo della malavita in città, accusa la polizia di non fare abbastanza. Il giovane Bruce (David Mazouz), tornato a casa con Alfred (Sean Pertwee), si reca alla Wayne Enterprise per discutere con i membri del consiglio di questioni precedentemente lasciate irrisolte e per dir loro di essere venuto a conoscenza del piano del Consiglio Segreto: ucciderlo. Tutto ciò, ovviamente, avrà le sue conseguenze … Nel frattempo Leslie (Morena Baccarin) torna a Gotham City, dopo aver iniziato una relazione con il figlio di Carmine Falcone (John Doman). Inoltre Gordon viene coinvolto dalle vicende squilibrate di Jervis Tetch, l’ipnotizzatore, arrivato in città per cercare la sorella Alice, scomparsa da tempo.

• L’Oscurità nell’oscurità: la Corte dei Gufi
• L’alba della follia: i nuovi cattivi di Gotham
• Il debutto alla regia di Ben McKenzie
• Gotham: Incontro al Comic-Con 2016
• Scene eliminate