1964. In una tradizionale scuola cattolica di Brooklyn regna il rigore e l'osservanza alle regole imposte da Suor Aloysius (Meryl Streep). Suor Jame (Amy Adams) e il predicatore Padre Flynn (Philip Seymour Hoffman) cercano di spezzare questa egemonia, aprendo le porte a una ventata di modernità. Ma quando il prete viene sospettato di molestie ai danni di uno scolaro...