L'azione si sposta a Los Angeles ad un mese di distanza dagli eventi narrati nella terza stagione e vede Michael, evaso dal penitenziario di Sona, andare alla ricerca della Compagnia e di Gretchen per vendicarsi della morte di Sara. Durante la ricerca viene condotto da Don Self, agente speciale della sicurezza nazionale, il quale gli propone di portare a compimento quel che suo padre Aldo ha tentato di fare per anni, ossia distruggere La Compagnia, cosa che sarebbe possibile solo entrando in possesso di Scylla, il cosiddetto "libro nero" di tale organizzazione.
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Versione estesa episodio "La scelta finale"
Fade Out: Episodio finale
Il piano, l'esecuzione, la pallottola
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